Als Ausgangspflanze für Agro-Diesel können verschiedene ölhaltige Pflanzensamen wie Raps, Sonnenblumen, Lein, Soja oder Palmfrüchte genutzt werden. Aus heimischer Erzeugung spielt vor allem Rapsöl eine große Rolle.
Aufgrund der begrenzten Mengenverfügbarkeit von europäischem Rapsöl suchen Biodieselhersteller vermehrt nach anderen pflanzlichen Rohstoffen zur Agro-Dieselproduktion. Da auch der Import von Rapsöl aus Kanada inzwischen an seine Grenzen gestoßen ist, richtet sich der Blick immer stärker auf Palm- und Sojaöle.
Das Öl der europäischen Rapspflanzen wird aber nicht nur von der Agro-Dieselindustrie, sondern auch von der Lebensmittelindustrie nachgefragt. Weil es nicht wie Sojaöl aus den USA oder Argentinien gentechnisch verändert ist, wird es als wichtiger Bestandteil vieler Lebensmittel (z. B. Margarine) geschätzt.